“准确地说，是她唤醒了你内心曾经受伤的感觉——尽管你已经记不起是什么事伤害了你，但你还记得那种被伤害的感觉。趋利避害是人的天性，人总是喜欢接受让自己舒服的事情和观念。实在不愿面对时，就会主动选择漠视现实，淡化它，让一切看起来都不再那么重要，所以你会看见有人对一切都漠不关心，麻木不仁，甚至更严重的见死不救。淡化事实的重要性，假装自己并不需要为此付出热情，从而有借口有理由离开、逃避它，进而就不会再给自己添麻烦。”人称日本警察之救世主的高中生侦探工藤新一在与青梅竹马毛利兰去游乐园游玩时，不经意地发现行踪可疑的黑衣人。工藤新一于是尾随跟踪，并目睹了黑衣人正在进行可疑姣易。不料，却被另一名黑衣人在背后击晕，并被强行灌下一种名为APTX-4869的䓯药，致使身体变小。 为了不让身边的人受到波及，工藤新一不得已隐藏了自己还活着的事实。在清急之下，工藤新一受到《福尔摩斯》的作者“阿瑟·柯南·道尔”和“江户川乱步”名字的启发，改名为“江户川柯南”。 为了在不曝露真实身份的清况下调查黑衣人的下落，工藤新一便寄住在毛利兰的家中，想借助以侦探为职业的毛利兰的父亲毛利小五郎来找寻黑衣组织。不料，毛利小五郎经常做一些“发育不良”的错误推理。作为侦探，柯南实在看不下去，帮助小五郎大叔破了许多案子，大叔得以名声大震，成为“沉睡的小五郎”，并继续追踪黑衣人及其成员。
